虽然拥有强大的计算能力，但是一个COM-Express电脑没有对数据采集和分析的射频模拟信号提供直接支持。此外，多核心x86处理器现在已经广泛采用，在可预见的未来，将没有足够的带宽来实时处理射频信号。因此，需要某种形式的输入/输出和处理扩展。

　　正如的COM-Express将电脑重新包装成一个带有中间层扩展卡的形式， 输入/输出卡也可做成适合应用在嵌入式仪器中的一种小而坚固耐用的外形。这种形式之一被称为PMC (PCI中间层卡） 。 PMC模块支持PCI或支持PCIe (PCI Express)进行总线通信，采用台式电脑相同的标准，但打包成一个小而坚固耐用的形式。

　　继承了PCI总线的PCI Express是经批准的PC行业替代PCI 输入/输出扩展的标准。 PCIe特点是与PCI软件的兼容性，并且大大提高的吞吐量是PCI的64倍。此外，总线特色是保证服务质量和P2P (点对点）数据流的能力，使其成为实时应用最佳选择。

　　该嵌入式仪器的COM Express电脑完成初始化、监督控制、用户接口以及在射频处理应用中高性能计算的职责。基于PCI Express的PMC模块提供输入/输出和数字信号处理扩展，所示框图如下。

　　用户界面的设备，如键盘，鼠标和显示器可能做成诊断端口或全部省略。另外，访问流行的嵌入式用户接口控制器件，如按钮，图形OLED(有机发光显示器Organic Light Emitting Display)显示器等是常见的嵌入式仪器可以提供的功能。同样，USB和硬盘接口在初步设计中是隐藏的或省略的, 或作为可选设备，只有在设计系统中才提供。

　　嵌入式仪器的电脑运行的是标准Windows或Linux及其变种，如XP或openSUSE 10.2,充分利用现有的PMC模块驱动。这些电脑都提供了用于高性能开发的信号处理的C++库，这些基于最佳化英特尔高性能多媒体函数库的C++库在一个标准x86平台上提供世界一流的DSP功能和性能。

　　两个PCI Express XMC模块端口所提供输入输出扩展。一个通常用于PMC模块的实现RF前端的模拟输入和输出和基于FPGA的数字信号处理能力。第二个端口是没有确定用途可用于未来的扩展。许多的PCIe的兼容PMC模块兼容这个端口可以提供额外的功能，如光通道的以太网通信，辅助语音或超声波波段模拟通道或额外的FPGA资源。