天窗在使用时，会出现有时不能关闭、在打开后不能完全关闭或者起翘后不能完全关闭的情况，这时需要对其进行初始化设定。天窗在初始化过程中没有防夹功能，勿将手伸入开启的天窗中。
    1．装有MD2电动机的天窗初始化方法
    1）首先用手动方式强制关闭天窗。
    2）取下顶灯盖板（天窗开关的面板），断开电动机线束插头（图14）或断开蓄电池负极线，等待10s后再接上线束或电源。

3）如图15所示，将开关由关闭位置旋向开启位置方向约15°，再迅速旋回到关闭位置，听见电动机有 “咯哒”的响声后，按住按钮，此时天窗将自动完成一个循环的运行一个自动循环完成后则表明天窗初始完成。

4）关闭点火开关5-7s后，天窗设定记忆完成。
2．装有MD4电动机的天窗初始化方法

1） 如图16所示，在关闭位置按住开关，等待25-30s。天窗开启到最大化。

2） 玻璃会抖动一下，这时松开并再次按住开关，此时天窗将执行下落、开启、关闭这一自动循环，这也说明天窗初始化完成。
    如由于误操作，初始化失败，天窗没有动作，请先关闭车钥匙等待10s，重新按照上述步骤再操作一次。

    这两种电动机初始化的差异如下：
    MD2电动机初始化前需要先断电，初始化后需关闭点火开关等待5-7s，初始化全过程为60s； MD4电动机直接按住开关即可初始化，但等待时间较长，初始化全过程需要70s左右。

    大众车型天窗MD2与MD4电动机的区分，以下面的底盘号为界限，之前的车辆使用的是MD2电动机，底盘号之后（含）的车辆使用的是MD4电动机。
    速腾A3073380（灰色内饰）A3070251（米色内饰）
    迈腾A3048927（灰色内饰）A3049968（米色内饰）
    高尔夫A6 A3230545（灰色内饰）A3230755（米色内饰）
新宝来A3061163（灰色内饰）A3061161（米色内饰）