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工艺流程安排：有些清洁问题也是由于工艺流程安排上的不当所造成的。比如，图5显示的是国外企业中的阀体维修区域，这要比国内企业的阀体部门（如果有的话）要干净很多。因为阀体是比较精密的部件，有时仅仅因为阀芯被脏的手摸过以后就会引起日后的卡滞，一些精密的改良阀芯甚至因为沾上杂质就无法顺利装入阀体，因此国外再制造企业中阀体的装配区域都是非常清洁的（图6），而国内企业往往在阀体区域到处流油，这种不整洁的环境会影响阀体的配装以及测试。比如阀体的真空测试就需要阀体保持干爽清洁的状态才能测得准确。这些都是由于清洁以及工艺流程安排上的疏忽而造成的。
批量化加工：在一个成熟的再制造企业并不象制造企业那样全是流水线式的操作过程。零部件可以进行批量化加工（图7），而对变速器总成的分解、组装则还是以几个人的工作组来完成的。一般从分解、清洗、零部件检查、小总成组装、变速器总成组装，一个小组只需要4～5个人即可，一个小组专做一种变速器，这样效率最高。当分解清洗后，有组员对各零部件进行检查，以判别是否能继续使用，所有零部件检查后，零部件部门会根据系统里的检查情况，比对标准工艺文件，自动安排将需要替换的零部件送到装配组（图8）。
为了保证质量和核心技术，再制造厂都会有自己的阀体维修部门和变扭器翻新部门，这些往往是比较关键的技术，通常不会外包，而是形成自己独立的部门。
