不过其实，价格过于低廉的空调滤芯通常都不能保证其过滤材料的性能和过滤效果，也就不放在今天的讨论范围内。我们只讨论那些能够达到国家标准，或者说能够达到行业中上游水平的滤芯。
首先是过滤器的工作效率。从测试方法来说，国内常用的标准中要求汽车空调滤芯的体积不应小于800立方cm（约20 cm×20 cm×2 cm），这是出于与空调系统风量相匹配的考虑。毕竟出风量与出风面积息息相关，而要保证过滤器的效果够好，寿命够长，滤芯中的滤材也必须达到一定的体积。所以只要车型不是过于奇特，其空调滤芯都是能达到这个最小值的。但空气净化器滤芯却没有相应的标准去规定其最小体积，有些老型号空气净化器的滤芯体积只有空调滤芯的一半大小。再考虑到其中需要包含颗粒过滤部分和活性炭部分，其容纳能力和寿命可想而知。
再看看滤芯对2种污染物的阻隔能力。对绝大多数消费者来说，空气净化器在这一方面的宣传也是最令消费者心动的。即便是免耗材的空气净化器，对PM2.5的过滤效率也能够轻松达到95%的级别，而空调滤芯上则很少见到这样的字样，即便有，通常也只是90%上下。可是消费者们往往不太清楚的一点，是这2个数据的测试方法其实区别还是很大的。
按照国家标准，即便是对风阻要求最低的过滤A级，其对直径3μm的颗粒过滤效率也必须达到60%，过滤效率要求高而风阻要求稍低的C级滤芯，对3μm的颗粒过滤效率则必须达到90%。虽然与绝大部分所标称的PM2.5过滤效率动辄95%以上空气净化器相比，在数值上低了一点，但其实专业人士一看2种产品对应的测试方法就明白了。其测试条件的苛刻程度是相差非常多的。
空调滤芯的测试标准中，风量规定在300立方 m/h比而空气净化器的测试标准中，封闭空间内用净化器自己的风扇做循环，风量充其量也就在20~30 立方Mm/h。因此，空调滤芯的空气流量大了一个数量级，相对应的风压和对已经吸附灰尘的扰动都有非常大的差异。所以，仅以一个PM2.5过滤比例有差异，显然是不能够就此判定空调滤芯不如空气净化器的。不过要想定量地比较两者过滤能力到底孰优孰劣，就需要将两者的滤材做成同样形状，按同样的检测方法去比较数值才能准确判断了。
空气净化器对于有害气体的过滤能力，也是所有产品的重要宣传点之一，平均甲醛去除率基本都在90%以上，甲苯去除率更是很多都能够达到99%。而回头看看空调滤芯，其中单效，或者说颗粒式过滤器，对有害气体根本就没有过滤功能。双效，或者叫做组合式过滤器，虽然能够过滤有害气体，但所有见过这种滤芯的人都知道，滤芯的质量很轻，与普通的单效过滤器差不太多，体积也是完全一样，那么其滤材中活性炭的含量也就可想而知。活性炭含量少，虽然在初始状态下对有害气体的过滤能力还是不错的，但是由于相同体积的滤芯中既要分给颗粒滤材，又要留一些给活性炭层（图3），所以对两种污染物的容纳能力就都会受到制约。换句话说，其实际寿命也就会相应地缩短。
另外，有些空气净化器会在滤材中采用类似于催化氧化等技术，使滤芯带有一定的催化能力，这样的能力可以使滤材中收集的一部分有害气体甚至细菌等被氧化分解。这种功能给过滤器带来的最大好处就是，可以对活性炭部分做一定程度的自我清洁，从而提高滤芯的实际容量和使用寿命。这又无形中增加了车载净化器对传统空调滤芯的优势。
再从空气循环量方面比较：通常轿车空调的鼓风机使用的是12 V×4.5 A的接口，其鼓风机的送风量最大可以达到近100立方m/h。就算分配到车内空调的各个出风口，也不用担心风力不足的问题。而且其出风口分布在车内的各个部位，即便没有后排出风口，其下部出风口加前排上部出风口的风量也足够使气流的湍流带动整个后排座位空间的气流，扰动范围足够大。不过大部分车型内循环的进风口只有一个，而且通常位于手套箱下部。在这么大的进风量下，脚垫中沉积的大颗粒灰尘很容易被带入空调系统中，大量沉积在滤芯上，从而影响到其使用寿命。这点对于空气的循环是个不利的影响。
再看空气净化器，目前这类产品基本都是连接点烟器作为电源，功率基本在6~7W，最高也不会超过 10W，所以其风扇的风量比起车载空调也就差得远（图4）。不过作为外部设备，净化器有一个最大的优势就是安装位置灵活，可以放在诸如仪表台、中控台、后排座椅乃至前排头枕后方等位置，这样就可以根据实际需求自由地调整其对空气的扰动范围，使其发挥最大功效。
除了上述2点以外，还有一个特性是两者都需要考虑的，那就是滤芯的更换。虽然市面上已经出现了一些免耗材的空气净化器，但实际上其收集器部分也都是需要经常拿出来清洁的。
空调滤芯的更换因车而异，很多日系车空调滤芯的更换比较简单，只需要把手套箱拉出来，摘掉一个盖
板就行了，完全可以在1~2 min内完全以纯手工完成（图5）。但有些美系车的滤芯就会比较麻烦，要用改锥等工具拆掉很多盖板，有些还在非常别扭的部位，拆起来十分麻烦。但空气净化器的滤芯无一不是更换起来十分方便的（图6）。在这一点上，空气净化器有着天生的优势。
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